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轉換成能量前，蛋白質（protein）會先被轉換成胺基酸
氨基酸是蛋白質的基本組成部分，因此蛋白質被分解成所有身體組織使用的氨基酸。氨基酸佔運動過程中燃燒的燃料的約5-15％。
蛋白質被細胞中的各種酶水解形成氨基酸，之後被再循環到合成新的蛋白質。但是，如果身體處於飢餓狀態，則一些氨基酸將被分流到葡萄糖分解代謝的途徑中，以便產生能源供身體活動所需。
蛋白質消化和吸收
圖片引用來自:Joseph Feher, in Quantitative Human Physiology (Second Edition), 2017
上圖彩色圓圈表示一個個別單位的氨基酸。在胃階段，胃蛋白酶將蛋白質分解成多肽(polypeptides)和一些氨基酸(amino acid)。在腸道中，胰蛋白水解酶(pancreatic proteolytic enzymes)被腸激酶(enterokinase)激活並進一步將蛋白質分解成較小的寡肽(oligopeptides)和氨基酸。腸道絨毛刷狀緣(brush border)中的許多蛋白酶(proteases)完全消化蛋白質並將氨基酸釋放到運輸機制中，所謂的運輸機制是將氨基酸和一些二胜肽(di-peptides)和三胜肽(tri-peptides)送入腸細胞內。
胺基酸會產生能量
蛋白質會被分解成氨基酸，不同的氨基酸將被分流到葡萄糖分解代謝的特定路徑中，以便產生能源供身體活動所需(如下圖)。
各種胺基酸可在多種位置進入檸檬酸循環中進行分解代謝
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